環境資源科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム
チームリーダー 関 原明(Ph.D.)
研究概要

最先端のゲノム科学的方法により、環境ストレス適応・馴化に関するエピジェネティック、RNA、ペプチドの制御機構を明らかにし、化合物などの活用により新たな有用植物資源の創出法の開発を目指します。キャッサバの統合オミックス解析により塊根生成制御ネットワークを明らかにし、生産性向上などの有用植物資源の創出法の開発を目指します。
研究主分野
- 生物学
研究関連分野
- 総合生物
- 農学
キーワード
- 植物ゲノム発現制御
- 環境ストレス適応
- キャッサバ
- エピジェネティック制御
- RNA制御
主要論文
- 1.
Sako, K., Kim, J.M., Matsui, A., Nakamura, K., Tanaka, M., Kobayashi, M., Saito, K., Nishino, N., Kusano, M., Taji, T., Yoshida, M. and Seki, M.:
"Ky-2, a histone deacetylase inhibitor, enhances high-salinity stress tolerance in Arabidopsis thaliana."
Plant Cell Physiol. 57, 776-783 (2016). - 2.
Kim, J.M., To, K.T., Matsui, A., Tanoi, K., Kobayashi, N.I., Matsuda, F., Habu, Y., Ogawa, D., Sakamoto, T., Matsunaga, S., Bashir, K., Rasheed, S., Ando, M., Takeda, H., Kawaura, K., Kusano, M., Fukushima, A., Endo, A.T., Kuromori, T., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Torii, C., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Ogihara, Y., Saito, K., Shinozaki, K., Devoto, A. and Seki, M.:
"Acetate-mediated novel survival strategy against drought in plants."
Nature Plants 3: 17097 (2017). - 3.
Nguyen, H.M., Sako, K., Matsui, A., Suzuki, Y., Mostofa, M.G., Ha, C.V., Tanaka, M., Tran, L.S.P., Habu, Y. and Seki, M.:
"Ethanol enhances high-salinity stress tolerance by detoxifying reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana and rice."
Front. Plant Sci. 8: 1001 (2017). - 4.
Matsui, A., Iida, K., Tanaka, M., Yamaguchi, K., Mizunashi, K., Kim, J.M., Takahashi, S., Kobayashi, N., Shigenobu, S., Shinozaki, K. and Seki, M.:
"Novel stress-inducible antisense RNAs of protein-coding loci are synthesized by Arabidopsis RDRs."
Plant Physiol. 175, 457-472 (2017). - 5.
Ueda, M., Matsui, A., Tanaka, M., Nakamura, T., Abe, T., Sako, K., Sasaki, T., Kim, J.M., Ito, A., Nishino, N., Shimada, H., Yoshida, M. and Seki, M.:
"The distinct role of RPD3-like histone deacetylases between class I and II in salinity stress response."
Plant Physiol. 175, 1760-1773 (2017). - 6.
Nakaminami, K., Okamoto, M., Higuchi-Takeuchi, M., Yoshizumi, T., Yamaguchi, Y., Fukao, Y., Shimizu, M., Ohashi, C., Tanaka, M., Matsui, M., Shinozaki, K., Seki, M.* and Hanada, K.*.:
"AtPep3 is a hormone-like peptide that plays a role in salinity stress tolerance of plants."
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, 5810-5815 (2018). - 7.
Rasheed, S.#, Bashir, K. #, Kim, J.M., Ando, M., Tanaka, M. and Seki, M.:
"The modulation of acetic acid pathway genes in Arabidopsis produces drought-stress tolerant plants."
Sci Rep, 8, 7831 (2018). - 8.
Sako, K., Futamura, Y., Shimizu, T., Matsui, A., Hirano, H., Kondoh, Y., Muroi, M., Aono, H., Tanaka, M., Honda, K., Shimizu, K., Kawatani, M., Nakano, T., Osada, H., Noguchi, K. and Seki, M.:
"Inhibition of mitochondrial complex I by the novel compound FSL0260 enhances high salinity-stress tolerance in Arabidopsis thaliana."
Sci Rep, 10, 8691 (2020). - 9.
Utsumi, Y., Tanaka, M., Utsumi, C., Takahashi, S., Matsui, A., Fukushima, A., Kobayashi, M., Sasaki, R., Oikawa, A., Kusano, M., Saito, K., Kojima, M., Sakakibara, H., Sojikul, P., Narangajavana, J. and Seki, M.:
"Integrative omics approaches revealed a crosstalk among phytohormones during tuberous root development in cassava."
Plant Mol. Biol. in press (2020). - 10.
Tokunaga, H., Do, T.N.Q, Nguyen, H.A., Pham, T.N., Matsui, A., Takahashi, S., Tanaka, M., Ngo, M.A., Nguyen, V.D., Le, H.H., Higo, A., Truong, M.H., Ishitani, M., Nguyen B.N.M., Nguyen, H.H., Srean, P., Vu, A.T., Nguyen, B.T., Nguyen, A.V., Yamaguchi, K., Tsuji, H., Utsumi, Y. and Seki, M.:
"Field transcriptome analysis reveals a molecular mechanism for cassava-flowering in a mountainous environment in Southeast Asia."
Plant Mol. Biol. (in press) (2020)
研究成果(プレスリリース)
2023年2月28日
植物の器官再生を制御する酵素を発見2022年8月25日
エタノールが植物の乾燥耐性を高めることを発見2022年8月2日
世紀を超えたDNA空間配置の謎を解明2022年6月22日
エタノールが植物の高温耐性を高めることを発見2021年11月26日
東南アジアのキャッサバ重要品種の形質転換系を開発2021年11月12日
難消化性デンプンを豊富に合成するキャッサバ植物の開発2021年9月3日
植物の乾燥耐性とバイオマス生産性を高める化合物を発見2021年7月12日
ハクサイの遺伝子発現調節機構を解明2020年9月9日
キャッサバ開花の謎に迫る2020年8月5日
キャッサバ塊根の形成メカニズムを解明2020年5月26日
植物の耐塩性を強化する化合物を新たに発見2018年5月17日
塩耐性を強化する植物ペプチドの発見2017年11月7日
植物の耐塩性に関わるヒストン脱アセチル化酵素の同定2017年8月1日
植物の新しい環境ストレス適応機構の発見2017年7月3日
エタノールが植物の耐塩性を高めることを発見2017年6月27日
植物に酢酸を与えると乾燥に強くなるメカニズムを発見2015年12月24日
植物の耐塩性を高める化合物を発見2014年11月20日
越冬性植物の遺伝子発現とタンパク質発現にタイムラグ
刊行物
関連リンク
メンバーリスト
主宰者
- 関 原明
- チームリーダー
メンバー
- 中南 健太郎
- 研究員
- 内海 好規
- 研究員
- 上田 実
- 研究員
- 徳永 浩樹
- 研究員
- 戸高 大輔
- 研究員
- 田中 真帆
- テクニカルスタッフⅠ
- 石田 順子
- テクニカルスタッフⅠ
- 高橋 聡史
- テクニカルスタッフⅠ
- 内海 稚佳子
- テクニカルスタッフⅡ
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